Inter Aide concentre ses efforts sur des zones d’intervention choisies pour la haute intensité des besoins et une forte densité de population, pour optimiser l’impact de son action.

Les actions s’inscrivant dans la durée, les zones choisies doivent bénéficier d’une certaine stabilité politique, offrir des conditions de sécurité satisfaisantes, afin de permettre une mobilisation effective de la population en accord et avec l’appui des autorités locales. La présence d’ONG y est généralement faible.

L’association s’est spécialisée sur les zones rurales  depuis quelques années ; les activités développées depuis longtemps en zones urbaines ont été transférées à l’association ATIA.

Les 6 pays où sont situées ces zones figurent tous parmi les plus pauvres selon le classement du PNUD : Éthiopie, Madagascar, Malawi, Mozambique, Sierra Leone, Haïti.